https://www.yisraelpedia.com/index.php?action=history&feed=atom&title=%D7%A7%D7%A4%D7%A1%D7%99%D7%93קפסיד - היסטוריית גרסאות2026-09-14T10:26:13Zהיסטוריית הגרסאות של הדף הזה בוויקיMediaWiki 1.43.8https://www.yisraelpedia.com/index.php?title=%D7%A7%D7%A4%D7%A1%D7%99%D7%93&diff=622879&oldid=previmported>Idoiz: /* איקוסהדרון */2025-03-25T11:34:11Z<p><span class="autocomment">איקוסהדרון</span></p>
<p><b>דף חדש</b></p><div>{{אנטומיה}}<br />
[[קובץ:CMVschema.svg|שמאל|ממוזער|280px|סכמת נגיף]]<br />
[[קובץ:Illustration of the Caspar-Klug model for viruses (or "Goldberg Polyhedra" or "Geodesic domes" or "Fullerenes").gif|שמאל|ממוזער|260px|<br />
איור של מודל גאומטרי משתנה בין שני קפסידים אפשריים.]]<br />
<br />
'''קפסיד''' (גם: '''קופסית הנגיף'''{{הערה|{{מילון אקדמיה|318|96413_1|קֻפְסִית הַנְּגִיף}}|כיוון=ימין}}) הוא קליפת [[חלבון]] של [[נגיף]]. הקפסיד מורכב ממספר יחידות משנה מבניות [[אוליגומר]]יות העשויות מחלבון הקרוי "פרוטומרים". תת-היחידות המורפולוגיות נקראות קפסומרים. הקפסיד מקיף את החומר הגנטי של ה[[נגיף]].<br />
ישנם סוגים שונים של קפסיד המסווגים על פי המבנה שלהם. לרוב הנגיפים יש קפסידים בעלי מבנה שבצורת [[סליל (צורה גאומטרית)|סליל]] או [[עשרימון]].{{הערה|{{צ-מאמר|מחבר=Jack Lidmar, Leonid Mirny, David R. Nelson|שם=Virus shapes and buckling transitions in spherical shells|כתב עת=Physical Review E|כרך=68|עמ=051910|שנת הוצאה=2003-11-25|doi=10.1103/PhysRevE.68.051910|קישור=https://link.aps.org/doi/10.1103/PhysRevE.68.051910}}}}{{הערה|{{צ-מאמר|מחבר=Graziano Vernizzi, Monica Olvera de la Cruz|שם=Faceting ionic shells into icosahedra via electrostatics|כתב עת=Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America|כרך=104|עמ=18382–18386|שנת הוצאה=2007-11-20|doi=10.1073/pnas.0703431104|קישור=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2141786/}}}} חלק מהנגיפים, כגון [[בקטריופאג']] פיתחו מבנים מורכבים יותר בשל אילוצי גמישות ואלקטרוסטטיקה.{{הערה|{{צ-מאמר|מחבר=Graziano Vernizzi, Rastko Sknepnek, Monica Olvera de la Cruz|שם=Platonic and Archimedean geometries in multicomponent elastic membranes|כתב עת=Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America|כרך=108|עמ=4292–4296|שנת הוצאה=2011-03-15|doi=10.1073/pnas.1012872108|קישור=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3060260/}}}} חלק מהנגיפים מכילים מעטפת, בהם הקפסיד מצופה בקרום שומנים הידוע בשם [[מעטפת נגיפית]]. המעטפת נוצרת על ידי הקפסיד מ[[קרום התא]] ה[[פונדקאי|מאכסן]].<br />
<br />
==מנגנון==<br />
לאחר שהנגיף מגיע לתא ומתחיל לשכפל את עצמו, יחידות משנה חדשות של הקפסיד מסונתזות באמצעות מנגנון [[ביוסינתזה]]. בנגיפים מסוימים, עם קפסידים בצורת סליל ובעיקר אלה עם גנום RNA, חלבוני הקפסיד מתאגדים עם גנום התא. בנגיפים אחרים, בייחוד בנגיפים מורכבים יותר עם גנום דנ"א כפול, החלבונים הקפסידים מתכנסים לתוך פרוקפסידים ריקים, הכוללים מבנה מיוחד עם פתח. דרך הפורטל הזה, דנ"א ויראלי ממוקם לתוך הקפסיד.{{הערה|{{צ-מאמר|מחבר=William W. Newcomb, Fred L. Homa, Jay C. Brown|שם=Involvement of the Portal at an Early Step in Herpes Simplex Virus Capsid Assembly|כתב עת=Journal of Virology|כרך=79|עמ=10540–10546|שנת הוצאה=2005-8|doi=10.1128/JVI.79.16.10540-10546.2005|קישור=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1182615/}}}}<br />
<br />
==צורות ספציפיות==<br />
[[קובץ:Adenovirus 3D schematic.png|שמאל|ממוזער|140px|קפסיד איקוסהדרון]]<br />
<br />
===איקוסהדרון===<br />
מבנה איקוסהדרון נפוץ מאוד בין נגיפים. איקוסהדרון מורכב מ-20 משולשים תחומים על ידי 12 קדקודים ו-60 יחידות אסימטריות. לכן, נגיף איקוסהדרון עשוי מ-60 יחידות חלבונים. מספר וסידור של [[קפסומרים]] באיקוסהדרון קפסיד ניתן לסווג באמצעות "מעין שוויון עקרון". דרך נוספת לבחון את מבנה האיקוסהדרון היא באמצעות השוואה לסכימה: איקוסהדרון בדומה לפוליהדרון בנוי מפנטמרים והקסמרים. המבנים יכולים להיות מיוצגים על ידי שני מספרים שלמים n,k. את המבנה ניתן לחשוב לפי h צעדים מקצה כל פנטמר, הטיה של 60 מעלות נגד [[כיוון השעון]], ולאחר מכן k צעדים עד הפנטמר הבא.<br />
<br />
===מוארך===<br />
[[קובץ:PhageExterior.svg|שמאל|ממוזער|120px|קפסיד מוארך]]<br />
איקוסהדרון מוארך הוא צורה שכיחה עבור ראשי [[בקטריופאג']]. מבנה כזה מורכב מגליל ומכסה בכל צד. הצילינדר מורכב מ -10 משולשים מאורכים. מספר Q,{{הערה|{{צ-מאמר|מחבר=Antoni Luque, David Reguera|שם=The Structure of Elongated Viral Capsids|כתב עת=Biophysical Journal|כרך=98|עמ=2993–3003|שנת הוצאה=2010-06|doi=10.1016/j.bpj.2010.02.051|קישור=http://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2010.02.051}}}} אשר יכול להיות כל מספר שלם חיובי מציין את מספר המשולשים, המורכבים ממקטעים אסימטריים, מרכיבים את 10 משולשי הצילינדר.<br />
<br />
===סלילי===<br />
[[קובץ:Helical capsid with RNA.png|שמאל|ממוזער|160px|קפסיד סלילי]]<br />
לרבים מהנגיפים יש קפסידים עם סימטריה סלילית.{{הערה|{{צ-מאמר|מחבר=SUSUMU YAMADA, TAIJU MATSUZAWA, KENJI YAMADA, SEIRO YOSHIOKA|שם=A modified signal intensity equation of carr-purcell-meiboom-gill pulse sequence for MR imaging.|כתב עת=The Tohoku Journal of Experimental Medicine|כרך=158|עמ=203–209|שנת הוצאה=1989|doi=10.1620/tjem.158.203|קישור=http://dx.doi.org/10.1620/tjem.158.203}}}}{{הערה|Aldrich RA (February 1987). "Children in cities—Seattle's KidsPlace program". ''Acta Paediatr Jpn''. '''29''' (1): 84–90. doi:10.1111/j.1442-200x.1987.tb00013.x. {{PMID|3144854}}.|כיוון=שמאל}}הטרנספורמציה הסלילית מסווגת לשתי קטגוריות: מערכות סליל חד-ממדיות ומערכות סליל ממדיות. יצירת מבנה הסליל מסתמך על קבוצה של מטריצות משתנות וסיבוביות אשר מקודדות במאגר הנתונים של חלבון. סימטריה סלילית מוצגת על ידי הנוסחה P = μ x ρ, כאשר μ הוא מספר היחידות המבניות ליחידה של הסליל, ρ היא עלייה אקסיאלית ליחידה ו- P הוא זווית השיפוע של הסליל. המבנה הוא אמר להיות פתוח בשל המאפיין כי כל נפח יכול להיות מוקף על ידי שינוי אורך של הסליל.{{הערה|שם=principles6253|{{צ-ספר|שם=Principles of virology|מקום הוצאה=Washington, DC|מו"ל=Vol. 1: Molecular Biology.|מהדורה=Third edition|שנת הוצאה=|קישור=https://www.worldcat.org/oclc/234176253|oclc=234176253}}}}<br />
<br />
==תפקידים==<br />
תפקידי הקפסיד הם:<br />
*להגן על הגנום<br />
*לקשר את הגנום<br />
*לבצע אינטראקציה ליחידה מארחת<br />
<br />
הנגיף חייב להרכיב קליפת חלבון יציב כדי להגן על הגנום מפני חומרים כימיים קטלניים. אלה כוללים צורות של קרינה טבעית, ערכים קיצוניים של pH או טמפרטורה, [[אנזים פרוטאוליטי|אנזימים פרוטאוליטיים]]. עבור נגיפים שאינם עטופים בקליפה, הקפסיד עצמו עשוי להיות מעורב באינטראקציה עם קולטנים על התא המארח, דבר שיוביל לחדירה של [[קרום התא]] המארח. מסירת הגנום מתרחשת על ידי פירוק של הקפסיד ושחרור של הגנום לתוך הציטופלסמה, או על ידי פליטת הגנום דרך פתח ספציפי במבנה ישירות לתוך [[גרעין התא]] המארח.<br />
<br />
==תכונות כימיות==<br />
חלקיק נגיפי חייב להיות ב[[מצב מטסטבילי]], כך ניתן ליצור אינטראקציות עם תא המארח חדש בקלות. כשמצב האנרגיה החופשית הוא מינימלי כלומר, כשהמערכת נמצאת במצב של שיווי משקל, יחידות משנה של הקפסיד לא ישנו את האינטראקציות המולקולריות שלהם כיוון שהדבר לא משתלם אנרגטית. לכל יחידת משנה של הקפסיד יש קשרים זהים עם שכנותיה, ושתי יחידות הקשר בדרך כלל ביחסי קשר לא קוולנטי. הקשר הלא קוולנטי מחזיק את היחידה המבנית יחד. התהוות של קשרים לא קוולנטיים בין יחידות משנה מקופלות כראוי מובילה להרכב נטול שגיאות ולמזעור האנרגיה החופשית, תוך שמירה על מצב מטהסטבילי.{{הערה|שם=principles6253}}<br />
<br />
==מקור והתפתחות==<br />
ההשערה הרווחת היא שחלבונים קפסידים ויראליים התפתחו מחלבונים תאיים שתפקידהם מגוונים. גיוס חלבונים תאיים התרחש בשלבים שונים של האבולוציה, כך שכמה חלבונים תאיים נתפסו וחוזרו מחדש לפני התפלגות האורגניזמים לשלושת תחומי החיים העכשוויים, בעוד שאחרים חוזרו לאחרונה. כתוצאה מכך, חלק מהחלבונים הקפסידים נפוצים בנגיפים המדביקים אורגניזמים הקשורים רחוקות (למשל, חלבונים קפסידים עם קפל גלילי), בעוד שאחרים מוגבלים לקבוצת נגיפים מסוימת (למשל, חלבונים קפסידים של אלפא-נגיפים).<br />
<br />
==ראו גם==<br />
*[[נגיף]]<br />
<br />
==לקריאה נוספת==<br />
*{{קישור כללי|כתובת=https://www.pnas.org/content/86/15/5781.short|כותרת=תפקיד של קפסיד בחיסון האנושי|אתר=[[PNAS]]|שפה=אנגלית}}<br />
*{{קישור כללי|כתובת=https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0022283683714063|כותרת=מבנה הרפס סימפלקס נגיפים Capsid מולקולרית הרכב של הפנטונים ואת טריפקסס|אתר=[[ScienceDirect]]|שפה=אנגלית}}<br />
<br />
==קישורים חיצוניים==<br />
{{ויקישיתוף בשורה}}<br />
* {{קישור כללי|כתובת=http://learn.snunit.k12.il/databases/seder/upload/sars/virus.html|כותרת=קפסיד|אתר=[[סנונית]]|שפה=עברית}}<br />
* {{קישור כללי|כתובת=https://davidson.weizmann.ac.il/online/minutescience/מדע-בדקה-לקרוא-את-הספר-בלי-לפתוח-אותו-כלל|כותרת=הבנת תהליך הפתיחה של הקופסית כתרומה לחקר נגיפים|אתר=[[מכון ויצמן]]|שפה=עברית}}<br />
* {{קישור כללי|כתובת=https://www.youtube.com/watch?v=8_bWUPGXomE|כותרת=סרטון הסבר מבנה ותפעול|אתר=[[יוטיוב]]|שפה=אנגלית}}<br />
<br />
==הערות שוליים==<br />
{{הערות שוליים|יישור=שמאל}}<br />
<br />
{{בקרת זהויות}}<br />
<br />
[[קטגוריה:ערכים שבהם תבנית בריטניקה אינה מתאימה]]<br />
[[קטגוריה:חלבונים]]<br />
[[קטגוריה:נגיפים]]<br />
[[קטגוריה:וירולוגיה]]</div>imported>Idoiz